Predhodnica današnje Fakultete za zdravstvene vede je Visoka šola za zdravstvo Novo mesto, ki je bila akreditirana leta 2007, z izvajanjem visokošolskega strokovnega študijskega programa Zdravstvena nega pa je začela v študijskem letu 2008/2009. Leta 2010 je bil akreditiran še magistrski študijski program Vzgoja in menedžment v zdravstvu - oktobra 2010 je bila tako na visoko šolo vpisana prva generacija magistrskih študentov.
Razvoj institucije je dal podlago za preoblikovanje iz visoke šole v fakulteto. Leta 2013 je institucija tako prejela soglasje za preoblikovanje iz Visoke šole za zdravstvo Novo mesto v Fakulteto za zdravstvene vede Novo mesto. Leta 2015 je fakulteta prejela soglasje NAKVIS k študijskemu programu 3. stopnje Edukacija in menedžment v zdravstvu. Tako je postala prva zdravstvena fakulteta v Sloveniji z akreditiranimi programi za razvoj kariere strokovnih profilov na področju zdravstva na vseh treh stopnjah.
Kot soustanoviteljica Univerze v Novem mestu je Fakulteta za zdravstvene vede leta 2018 naredila še en pomemben korak, s katerim se je zavezala k še višji kakovosti na vseh ravneh delovanja in k napredku znanosti in stroke na področju zdravstvenih ved.
Danes je Fakulteta za zdravstvene vede Univerze v Novem mestu izobraževalna ustanova, ki je uveljavljena v slovenskem ter mednarodnem prostoru. Fakulteta odgovarja na potrebe sodobne družbe in z raziskovalnim delom, organizacijo ter soorganizacijo strokovnih in znanstvenih srečanj pomaga pri oblikovanju področja zdravstvenih ved.